MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 plasmid WSH-002_p3

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017141	CTTTCT	2	12	15	26	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017141	CAA	2	6	63	68	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017141	T	7	7	84	90	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017141	TCC	2	6	166	171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017141	CCT	2	6	182	187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017141	AAT	2	6	200	205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017141	TAG	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017141	ATTT	2	8	285	292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017141	AG	3	6	297	302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017141	CATG	2	8	331	338	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017141	ATG	2	6	496	501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017141	TAA	2	6	526	531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017141	TTA	2	6	548	553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017141	TAA	2	6	587	592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017141	ACTT	2	8	636	643	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017141	GA	3	6	670	675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017141	ATTTTT	2	12	700	711	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017141	AGA	2	6	742	747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017141	TCC	2	6	818	823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017141	ACT	2	6	827	832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017141	CAG	2	6	852	857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017141	CT	3	6	890	895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017141	TA	3	6	936	941	50 %	50 %	0 %	0 %	384044092
24	NC_017141	TTA	2	6	1005	1010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044092
25	NC_017141	CTT	2	6	1015	1020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044092
26	NC_017141	ATT	2	6	1049	1054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017141	AGGA	2	8	1062	1069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017141	TGTT	2	8	1084	1091	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017141	A	6	6	1109	1114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017141	TAA	2	6	1116	1121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017141	AAG	2	6	1209	1214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044093
32	NC_017141	AAG	2	6	1272	1277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044093
33	NC_017141	AGG	2	6	1315	1320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384044093
34	NC_017141	TTTCC	2	10	1379	1388	0 %	60 %	0 %	40 %	384044093
35	NC_017141	CTG	2	6	1416	1421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044093
36	NC_017141	T	6	6	1478	1483	0 %	100 %	0 %	0 %	384044094
37	NC_017141	AAG	2	6	1494	1499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044094
38	NC_017141	CAAAA	2	10	1619	1628	80 %	0 %	0 %	20 %	384044094
39	NC_017141	AATT	2	8	1648	1655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017141	A	8	8	1661	1668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017141	TATT	2	8	1711	1718	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017141	AG	3	6	1722	1727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017141	AT	3	6	1742	1747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017141	AT	3	6	1753	1758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017141	ACA	2	6	1770	1775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017141	ATT	2	6	1791	1796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017141	ACA	2	6	1843	1848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017141	TA	3	6	1890	1895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017141	TAA	2	6	1900	1905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017141	TTTA	2	8	1908	1915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017141	AT	4	8	1951	1958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017141	AATG	2	8	1988	1995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017141	AGT	2	6	2042	2047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044095
54	NC_017141	CAG	2	6	2077	2082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044095
55	NC_017141	AGC	2	6	2090	2095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044095
56	NC_017141	CAT	2	6	2130	2135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044095
57	NC_017141	ACA	2	6	2142	2147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044095
58	NC_017141	TCAA	2	8	2187	2194	50 %	25 %	0 %	25 %	384044096
59	NC_017141	CAT	2	6	2260	2265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044096
60	NC_017141	ATC	2	6	2327	2332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044096
61	NC_017141	TC	3	6	2383	2388	0 %	50 %	0 %	50 %	384044096
62	NC_017141	TCA	2	6	2407	2412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044096
63	NC_017141	A	6	6	2477	2482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017141	A	8	8	2484	2491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017141	CT	3	6	2609	2614	0 %	50 %	0 %	50 %	384044097
66	NC_017141	GCTT	2	8	2615	2622	0 %	50 %	25 %	25 %	384044097
67	NC_017141	GTTA	2	8	2654	2661	25 %	50 %	25 %	0 %	384044097
68	NC_017141	ATA	2	6	2717	2722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044097
69	NC_017141	CCT	2	6	2855	2860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017141	A	7	7	2910	2916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017141	CTTT	2	8	2927	2934	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017141	TTA	2	6	2960	2965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044098
73	NC_017141	T	6	6	2972	2977	0 %	100 %	0 %	0 %	384044098
74	NC_017141	TTC	2	6	2980	2985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044098
75	NC_017141	CAT	2	6	3009	3014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044098
76	NC_017141	CTATTC	2	12	3041	3052	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384044098
77	NC_017141	AAT	2	6	3095	3100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044098
78	NC_017141	CTG	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044098
79	NC_017141	ACA	2	6	3114	3119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044098
80	NC_017141	CTC	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044098
81	NC_017141	T	6	6	3151	3156	0 %	100 %	0 %	0 %	384044098
82	NC_017141	AAT	2	6	3228	3233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044098
83	NC_017141	TC	3	6	3238	3243	0 %	50 %	0 %	50 %	384044098
84	NC_017141	TC	3	6	3257	3262	0 %	50 %	0 %	50 %	384044098
85	NC_017141	AT	4	8	3263	3270	50 %	50 %	0 %	0 %	384044098
86	NC_017141	TAAA	2	8	3279	3286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017141	CAT	2	6	3298	3303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017141	TACTG	2	10	3321	3330	20 %	40 %	20 %	20 %	384044099
89	NC_017141	CAG	2	6	3358	3363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044099
90	NC_017141	AAT	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044099
91	NC_017141	CTG	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044099
92	NC_017141	AACT	2	8	3482	3489	50 %	25 %	0 %	25 %	384044099
93	NC_017141	CTT	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044099
94	NC_017141	CAA	2	6	3574	3579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044099
95	NC_017141	TTA	2	6	3582	3587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044099
96	NC_017141	TAA	2	6	3595	3600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044099
97	NC_017141	TCA	2	6	3603	3608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044099
98	NC_017141	CTC	2	6	3656	3661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044099
99	NC_017141	TCTT	2	8	3672	3679	0 %	75 %	0 %	25 %	384044099
100	NC_017141	AAT	2	6	3697	3702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044099
101	NC_017141	GT	3	6	3721	3726	0 %	50 %	50 %	0 %	384044099
102	NC_017141	TAAT	2	8	3736	3743	50 %	50 %	0 %	0 %	384044099
103	NC_017141	ATTT	2	8	3759	3766	25 %	75 %	0 %	0 %	384044100
104	NC_017141	ATC	3	9	3793	3801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044100
105	NC_017141	AT	3	6	3806	3811	50 %	50 %	0 %	0 %	384044100
106	NC_017141	T	6	6	3823	3828	0 %	100 %	0 %	0 %	384044100
107	NC_017141	ATC	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044100
108	NC_017141	ATAC	2	8	3948	3955	50 %	25 %	0 %	25 %	384044100
109	NC_017141	CTT	2	6	3963	3968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044100
110	NC_017141	T	7	7	4008	4014	0 %	100 %	0 %	0 %	384044100
111	NC_017141	TC	4	8	4040	4047	0 %	50 %	0 %	50 %	384044100
112	NC_017141	AATC	2	8	4179	4186	50 %	25 %	0 %	25 %	384044100
113	NC_017141	TTG	2	6	4212	4217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384044100
114	NC_017141	TA	3	6	4230	4235	50 %	50 %	0 %	0 %	384044100
115	NC_017141	AGAA	2	8	4246	4253	75 %	0 %	25 %	0 %	384044100
116	NC_017141	TCT	2	6	4266	4271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044100
117	NC_017141	TAA	2	6	4278	4283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044100
118	NC_017141	TAA	2	6	4425	4430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044100
119	NC_017141	AATCAG	2	12	4467	4478	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384044100
120	NC_017141	CTC	2	6	4495	4500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044100
121	NC_017141	AAAG	2	8	4513	4520	75 %	0 %	25 %	0 %	384044100
122	NC_017141	CTC	2	6	4582	4587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044100
123	NC_017141	ATC	2	6	4642	4647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044100
124	NC_017141	TC	3	6	4646	4651	0 %	50 %	0 %	50 %	384044100
125	NC_017141	ATCA	2	8	4687	4694	50 %	25 %	0 %	25 %	384044100
126	NC_017141	CTT	2	6	4709	4714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044101
127	NC_017141	T	6	6	4734	4739	0 %	100 %	0 %	0 %	384044101
128	NC_017141	A	6	6	4740	4745	100 %	0 %	0 %	0 %	384044101
129	NC_017141	TCA	2	6	4746	4751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044101
130	NC_017141	TCC	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017141	T	6	6	4876	4881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017141	CT	3	6	4982	4987	0 %	50 %	0 %	50 %	384044102
133	NC_017141	CA	3	6	5041	5046	50 %	0 %	0 %	50 %	384044102
134	NC_017141	CTT	2	6	5060	5065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044102
135	NC_017141	AT	3	6	5213	5218	50 %	50 %	0 %	0 %	384044103
136	NC_017141	CAAA	2	8	5229	5236	75 %	0 %	0 %	25 %	384044103
137	NC_017141	A	7	7	5234	5240	100 %	0 %	0 %	0 %	384044103
138	NC_017141	AT	3	6	5279	5284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017141	ACT	2	6	5290	5295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017141	TCT	2	6	5329	5334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044104
141	NC_017141	AGGCTC	2	12	5336	5347	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384044104
142	NC_017141	GTTT	2	8	5373	5380	0 %	75 %	25 %	0 %	384044104
143	NC_017141	T	7	7	5378	5384	0 %	100 %	0 %	0 %	384044104
144	NC_017141	TC	3	6	5397	5402	0 %	50 %	0 %	50 %	384044104
145	NC_017141	TTAT	2	8	5475	5482	25 %	75 %	0 %	0 %	384044104
146	NC_017141	TGT	2	6	5553	5558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384044104
147	NC_017141	TCA	2	6	5601	5606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044104
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149	NC_017141	CAT	3	9	5674	5682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044104
150	NC_017141	TAT	2	6	5693	5698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044104
151	NC_017141	GAT	2	6	5761	5766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044104
152	NC_017141	CTTA	2	8	5774	5781	25 %	50 %	0 %	25 %	384044104
153	NC_017141	TCT	2	6	5786	5791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044104
154	NC_017141	TGA	2	6	5799	5804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044104
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158	NC_017141	A	7	7	5987	5993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017141	TATAT	2	10	6028	6037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_017141	CTT	2	6	6644	6649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044105
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170	NC_017141	TGCTC	2	10	6762	6771	0 %	40 %	20 %	40 %	384044105
171	NC_017141	CAT	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044105
172	NC_017141	CCT	2	6	6979	6984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.